在随后的孟加拉国和印度的疫情中，食用被受感染果蝠的尿液或唾液污染的水果或水果制品是最可能的感染渠道。目前还没有研究病毒在体液或包括水果在内的环境中的存留状态问题。

　　在尼帕病毒感染者的家人和照护人员中还发现了人际传播。在孟加拉国和印度后来的疫情期间，尼帕病毒通过与人的分泌物和排泄物密切接触而直接在人与人之间传播。

　　2001年，在印度的西里古里，卫生保健机构内也报告存在病毒传播，其中75%的病例发生在医院工作人员或访客中。2001年至2008年，孟加拉国报告的约半数病例系源自为感染者提供护理而导致的人际传播。

　　当前尚无特异性抗病毒药物和疫苗

　　在治疗方面，根据中疾控2021年发布的《关于印发尼帕病毒病预防控制技术指南的通知》，对于尼帕病毒的抗病毒治疗，“目前尚无特异性抗病毒药物。利巴韦林对治疗尼帕病毒脑炎可能有效”。

　　印度在没有有效治疗方法的前提下，该国国家疾病控制中心也推荐利巴韦林用于尼帕病毒感染的治疗，但不作为暴露后预防措施。不过根据当地在此前疫情中的真实世界研究，利巴韦林的治疗有效性仍然存疑。

　　期刊《Scientific Reports》于2018年发布一项研究显示，广谱抗病毒药物法维拉韦(又称T-705)在抗尼帕病毒研究中展现出积极的实验结果。该药目前已在日本获批用于治疗新发或再现的流感病毒感染。