1958年，松基一井、松基二井均未获突破，第三口基准井井位成为焦点。7月上旬，邱中建与杨继良、钟其权讨论后，一致认为松基三井应定在大同镇电法隆起上。面对地质部的不同意见，邱中建等人明确表示反对。9月3日，双方协商后达成一致。随后地震资料证实高台子存在明显背斜构造，技术人员据此微调井位。11月29日，石油工业部正式批准松基三井井位。

　　1959年9月26日，松基三井喷油，全场沸腾。时值国庆十周年，油田被命名为“大庆油田”。1982年，“大庆油田发现过程中的地球科学工作”获国家自然科学奖一等奖，邱中建是主要参与者。

　　1964年初，31岁的邱中建奔赴山东东营参加胜利油田会战。他建立“铁柱子”地质资料制度，制定25类、135项取全取准资料的要求。坨1井钻至沙河街组二段获高产，突破了以沙三段为主要目的层的旧框框。面对油水层交互出现的新难题，他得出胜坨油田是"两层楼"油田的结论——上下各有独立油水系统，被后续钻探完全证实。

　　随后邱中建整体研究渤海湾盆地。1974年，他在全国勘探工作座谈会上首次提出“复式油气聚集区”理论，指出多种因素相互交错形成综合性的油气聚集单元，成为陆相石油地质理论的核心要义，指导发现一大批大中型油气田。1985年，他作为主要参加者完成的《渤海湾复式油气聚集区（带）的形成理论与实践》获国家科技进步奖特等奖。