读博期间，吴琦杰加入了山东农业大学党员博士兴农团，在“学农为农、知农爱农、强农兴农”宗旨的指导下，积极服务农业强国建设。2021年6月，他担任生产经理，指导山东果力农业科技有限公司草莓工厂化种苗生产、苹果组培苗脱毒技术培训、设施草莓、桃专用新品种选育及高效栽培技术推广等工作。吴琦杰的助农事迹获得中国教育报报道3次、省级新闻媒体报道4次，还入围了2021年度中国“向善好青年”。

　　吴琦杰表示：“学院老师经常鼓励我们‘乡村振兴，青年学生大有可为’，现代农业发展空间很大，现代农村是一片大有可为的土地、希望的田野，希望我也能在这片沃土上扎根、成长、收获。”