加大黄河三角洲生物多样性和湿地保护力度，监测维护互花米草治理区13.1万亩，构建牡蛎礁、贝藻礁2.6万亩，修复海草床1500亩，累计修复盐地碱蓬5.2万亩，2024年科学组织生态补水1.83亿立方米，2024年5月，生态环境部《2023年中国海洋生态环境状况公报》发布，山东黄河三角洲国家级自然保护区生态环境状况等级为I级。不断强化科技支撑，建成东方白鹳保护研究中心、自然资源部黄河入海口陆海交互作用野外科学观测研究站等科研平台，优化提升国家公园感知平台，构建完善“天空地海”一体化监测体系，搭建黄河口国家公园智慧管理平台，打造“监测预警、分析研判、联动指挥、无人机调度”的预警处置闭环管理模式，实现黄河口国家公园的智慧化监测和管理。持续实施野大豆等原生植被封育保护，封育野大豆7.46万亩、陆海全梯度植物6万亩、原生植物保育2万亩，提高保护区物种丰度；2024年，环志丹顶鹤、白鹤、东方白鹳等珍稀鸟类个体25只，首次发现国家一级保护鸟类黑脸琵鹭、国家二级保护鸟类疣鼻天鹅在保护区繁殖，据2025年监测成果，自然保护区内丹顶鹤越冬数达到296只，繁殖12巢，成为丹顶鹤重要繁殖地和野外繁殖最南界；东方白鹳繁殖233巢、536只，创历年新高，累计繁殖东方白鹳4260只，黑嘴鸥繁殖数量稳定在1万余只。