为此，他深入到大内科病房做医生。据孙申田老先生回忆，当时病房的主任均是黑龙江省各大医院著名的西医专家，有着扎实基本功和前沿知识，且又学过中医，经验丰富。在这种环境下，孙申田的中西医理论知识和技术水平得到飞速提高。在哈尔滨医科大学神经内科进修时，孙申田师从于著名神经内科专家葛茂振，这位西医名家鼓励他大胆应用中医疗法。

　　1972年，孙申田学成归来，率先向医院建议组建针灸神经内科病房，结合北方地区多发脑病特点，将中医、中药、针灸系统引入脑病领域。他围绕头针疗法治疗脑病做了大量开创性研究，以“经颅重复针刺运动诱发电位研究”等成果，从实践与理论层面证实了大脑机能定位与头皮对应关系选穴的准确性，并首次提出“经颅重复针刺刺激技术”，比西方经颅磁刺激技术的提出早了整整十年。他主持的针刺促进神经损伤修复研究，从周围神经到脊髓再到脑，客观证实了针刺修复神经损伤的作用机制。

　　同时，孙申田老先生格外强调经络辨证的核心地位，将“病在上者下取之，病在下者高取之”等古典理论与临床选穴融会贯通，形成了独具特色的诊疗体系。

　　针药合璧 量中见真章

　　“针灸治标，汤药治本，针药并用，其效如鼓。”孙申田老先生在临床中从不拘泥于针法，凡遇血虚、失眠、月经不调、脱发等精血亏损之证，常以汤药配合针灸，内外兼治。