登革热与基孔肯雅热的传播媒介相同，流行区域基本相同，临床表现类似，较难鉴别，且可存在合并感染的情况。登革热发热多为中高热，持续时间更长，肌肉痛、腹部症状(腹痛、腹胀、便秘等)更明显，有出血倾向，外周血白细胞和血小板减少明显，红细胞压积、ALT或AST常增高，重症较基孔肯雅热多见，可出现休克、脑病、多器官功能障碍等并发症。而基孔肯雅热多为中低热，关节疼痛明显，可为首发症状，多累及远端小关节，外周血白细胞、血小板基本正常，重症少见。需核酸检测鉴别。在登革热流行高风险区，建议也对登革热进行检测。

　　(二)寨卡病毒病。

　　寨卡病毒病与基孔肯雅热的传播媒介相同，流行区域基本相同，临床表现类似，亦表现为中低热，可伴皮疹、头痛、关节痛、肌痛和结膜炎，孕妇感染可引起胎儿小头畸形。基孔肯雅热关节痛更明显。需核酸检测鉴别。

　　(三)传染性红斑。

　　由细小病毒B19感染引起。儿童感染可表现为持续中高热，常合并皮疹，皮疹为多形性、多部位分布，典型表现为面颊部红斑样皮疹伴有口周苍白圈，称之为“掌击脸”，也可出现受累关节部位红斑、关节痛，常见外周血红细胞下降。核酸及病毒抗体检测有助于鉴别诊断。

　　(四)其他。

　　本病还需与疟疾、其他甲病毒感染、流感、麻疹、风疹、传染性单核细胞增多症、风湿热、反应性关节炎、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等疾病相鉴别。

　　八、重症病例、重症高危人群和重症预警指标

　　本病重症少见，但境外基孔肯雅热疫情暴发时有重症及死亡病例报告，要加强病情监测，警惕重症病例发生。

　　(一)重症病例。