孔子担任过鲁国司寇,属于大夫级别,可以设立三庙,奉祀始祖、祖父和父亲,除始祖以外,祖父以上就难以祭祀。孔子去世以后,由于孔子思想的影响和弟子们的宣扬,在社会上很有名望。他的儿子孔鲤早逝而且没有著述,社会影响不大,但是孙子子思继承发展了孔子思想,道传孟子,开创思孟学派,是战国年间很有影响的思想流派,子思也是当时的名人。子思去世后,按照礼制规定,此时家庙中应该奉祀子思和孔鲤,已不能奉祀孔子。于是,子思的儿子孔白就将仍然保存的孔子故居改成奉祀孔子的庙宇,所以司马迁记载为“后世因庙”。子思卒于周威烈王二十四年(前402年),孔子故居改为孔庙的时间应该在这一年或略后。

　　逐渐扩容

　　曲阜孔庙在汉代很受重视。西汉时,“诸侯卿相至,常先谒而后从政”,到鲁国就任的相国们常常是先拜谒孔庙然后才去上任处理政务。西汉元帝时,诏“褒成君”孔霸以所食邑祀孔子,首开世爵奉祠的先例。在孔霸奉祀以前,祭祀、维护的费用是由孔子后裔自己解决,孔霸奉祀后,食邑收入成了祭祀、维护的主要来源,可以说,从此曲阜孔庙成为国家奉祀的庙宇。东汉永兴元年(153年),国家为孔庙设置管理官员,并开始给予专门的祭祀经费。鲁相乙瑛奏书朝廷,专门为曲阜孔庙设立了俸禄为一百石的守护小吏卒史,从此曲阜孔庙正式纳入国家管理。