在孙博文的晚期创作中，如果说山川幻象是其超感知与客体世界关系的产物的话，那么，灵魂幻象则是其超感知面对内心世界的结果。如前所述，禅修是孙博文返回灵魂与生命本原的最好路径，也是他洞见灵魂与生命本质的最佳方式。为此，孙博文写了多首象征意味浓厚的“禅诗”。如“白云深处有高师，糊涂切相任天机。试看拖泥带水笔，正是禅意入画时。”禅修不仅让灵魂幻象总是若隐若现地浮动着“虚静”的意味，或显现出“万法皆空”的色彩，还为灵魂幻象提供了多种图像生成的方式：或借助于具有集体无意识认同的象征符号，或从心灵感知中获取那些不可名状的隐秘之形——这类图像更像是灵魂的分泌物，飘飘渺渺，杳杳冥冥，幽远而深邃。至于灵魂幻象的意涵，则指向更为复杂含混，我们只能尝试着加以诠释。1997年的大病之后，与死神擦肩而过的孙博文，在创作中充满了对“重生”主题的向往，这一向往的表达，完美地落实在《凤舞九天》（1998）、《涅槃》（2001）等作品中。《涅槃》的凤凰造型似生命分解、离散前的剪影，又似重生之际的昂扬之姿。烈焰燃炽所映射的太空，化作桔红色的幻景，似生命涅槃的隆重仪式，又似生命复活后冲上九霄的盛大典礼——这或许是孙博文参透生死之谜后，从灵魂深处幻化出的心象，也是他对生命最为神秘的理解与写照。与“凤凰”幻象相比，来自于灵魂、生命感知的隐秘之形更加幽深难测。