与梵高、石鲁相似，由生理疾病所导致的精神基因突变，或许是孙博文晚年人格变异与创作风格转向的原因。1997年，孙博文在一场几乎致命的脑垂瘤手术后，人格一分为二：清醒的、具有日常意识形态属性的人；半清醒的、半癫狂的、具有形而上属性的艺术家。如果我们稍加辨析，不难发现，对孙博文的人格与艺术观而言，所谓的精神基因突变，其意涵是多重的：首先，来自于死亡的追逐，迫使孙博文重新思考生命的价值与本原意义，在内省中成为一个生命的觉者。其觉悟的鲜明标志是人格上的由“老”返“童”，即由复杂的、成熟的、世俗的人格不断向纯真的人格与生命状态还原；其次，由生命、人格的本真状态向形而上世界的跃迁与升华，不仅构成孙博文晚年精神生活的主要内容，也使其从世俗画家状态飞升至超越性主体的状态。无论批评家们在这方面存在多少争议，都无法否认这样的事实：疾病已成为精神超越的方法与路径。疾病的发生、疗愈以及对死亡拒绝的过程，就是孙博文升华为生命的觉者与超越性主体的过程。

孙博文 《乘月天水合》144×361cm 2001年

准确地讲，生命的觉者与超越性主体，是孙博文晚期新艺术观的人格基石与精神源泉。以此为始，对生命价值与生命本原的觉悟与思考，并在形而上世界中追寻其意义，已成为孙博文晚期创作的主要价值皈依——其神秘的山水、宇宙图像与大泼彩所发散出的生命意识，均来自于此。